Vedenvaihto on olennainen asia akvaarionhoidossa. Ajan mittaan veteen kertyy kaikenlaisia kuona-aineita, kuten nitraattia ja fosfaattia kalojen jätöksistä, ruoasta jne. Näistä on isoina pitoisuuksina haittaa. Näiden pitämiseksi sopivina auttaa vain vedenvaihto. Myös kasvit imevät näitä kuona-aineita jonkun verran itseensä. Pienistä altaista vaihto onnistuu vielä hyvin ämpäreillä, mutta isommista kannattaa vaihtaa pitkän puutarhaletkun avulla. Letku sopii kyllä myös pientenkin altaiden vedenvaihtoon. Sopiva vaihtomäärä on noin 50-75 % viikossa.